Desde las semillas de la caña de azúcar hasta el producto terminado, la producción agro-industrial de Cooperativa Manduvirá y sus socios es exclusivamente orgánica, cumpliendo estándares y regulaciones de certificaciones internacionales. Manduvirá representa gestión sostenible, conservación de la naturaleza y mitigación del cambio climático. El Comité Orgánico de la Cooperativa mantiene varios inspectores que visitan continuamente las fincas, informan sobre plantaciones orgánicas y controlan el cumplimiento de las normas internacionales de certificación.

- No se queman los residuos en todo el terreno de la finca: Con este método se preserva la biodiversidad del suelo.
- No se usan fertilizantes químicos o sintéticos: en su lugar se utilizan los fertilizantes o abonos verdes. También se aplica el estiércol de vaca, materiales orgánicas y especialmente el fertilizante que la Cooperativa produce en su propria fábrica
- Diversidad natural en la granjas ecológicas: Por lo menos 7% de la finca tienen que ser reservas naturales, con protección especial de la biodiversidad de plantas y especies.
- Disposición de residuos: El cuidado de residuos orgánicos y no orgánicos está en equilibrio con la naturaleza y se minimiza el uso de recursos no renovables.
- Cosecha Sostenible: Al tratar el suelo y plantar la caña, el productor debe usar un mínimo de maquinaría, dando preferencia a la siembra directa y rotación de cultivos para mantener la explotación del suelo en equilibrio.
- No se usan aditivos innecesarios, como aromas y colorantes: Blanqueamiento natural: En lugar de azufre, que en la producción convencional blanquea el azúcar a su color blanco brillante, sólo se añaden cal natural y agua caliente. Por lo tanto, los cristales de azúcar orgánicos todavía están cubiertos con una fina capa de jugo de caña, dándole su color especial y sabor dulce extraordinario.
- Cultivo biodinámico: A raíz de las prácticas regenerativas, los procesos de compostaje de Manduvirá son un ejemplo de como convertir el desperdicio de una parte de la producción en energía para otra, incrementando la capacidad de auto-renovación de la producción y generando sostenibilidad ambiental.